Como se mencionó anteriormente, el asentamiento prehispánico está constituido por cuatro grupos arquitectónicos: Tutil, Lamay, Kinichná y Dzibanché, de los cuales sólo los dos últimos han sido parcialmente explorados y pueden ser visitados. El recorrido por el conjunto Dzibanché inicia con el Edificio VI o Templo de los Dinteles, un edificio relativamente aislado, cuya primera etapa constructiva conserva un basamento con cuerpos ornamentados con un diseno de talud y tablero similares a los construidos en Teotihuacan por esos tiempos. En la porción superior puede verse un templo bien conservado y correspondiente a la segunda etapa constructiva en el que destaca un dintel de madera con la fecha 554 después de Cristo.

Continuando el recorrido se llega hasta la Plaza Gann, nombrada así en recuerdo del primer visitante académico al sitio. En esta zona se conservan una serie de edificios de diversas funciones y temporalidad, entre los que por supuesto destaca el Edificio 11 o Templo de los Cormoranes que es un gran basamento de planta cuadrangular sobre el que se encuentra un templo de excepcional altura y estrechez, complementado por unos pequenos tapancos en sus extremos; sobre este templo pueden apreciarse los restos de una crestería que en su tiempo había estado estucada y profusamente decorada. Es interesante senalar que en el interior del basamento se encontró un sistema de tres cámaras abovedadas, una de las cuales resguardaba los restos de un personaje de alto status, acompanado por una ofrenda que incluía diversas piezas de cerámica, entre ellas, el vaso policromo que da nombre al edificio, así como una máscara de jadeíta y diversos ornamentos del mismo material.

Complementando la distribución de la Plaza Gann se encuentran las estructuras 10, 11, 12 y 14, que corresponden a edificios residenciales construidos durante el Clásico Tardío y Terminal (600-1000 después de Cristo), así como el Edificio 13 o Templo de los Cautivos, donde se encontró un basamento con varias etapas constructivas (la primera del Clásico Temprano) en el que destaca una escalera construida hacia 850-1000 después de Cristo y en la que se emplearon grandes bloques de piedra desmontados de otra estructura más antigua. Estos bloques están grabados con diversas representaciones de cautivos acompanados de textos glíficos que hacen referencia los nombres de los personajes, así como a un enfrentamiento bélico que aparentemente habría tenido Dzibanché con Calakmul.

El arreglo de la plaza se complementa con el Edificio 16 o Templo de los Tucanes, que es también un edificio con una larga secuencia constructiva en el que destaca la arquitectura del Clásico Temprano y las posteriores renovaciones que en él se hicieron.

Caminando hacia el extremo noreste de la Plaza Gann puede accederse a la Plaza Xibalbá que funcionó como el centro principal de la ciudad desde tiempos muy tempranos. Es posible que el trazo original de la plaza corresponda al Preclásico Tardío (200 antes de Cristo), aunque las estructuras que hoy pueden verse comenzaron a ser construidas en el Clásico Temprano (200 después de Cristo). La estructura principal de la plaza es el Edificio 1 o Templo del Búho, que es una construcción con al menos tres etapas constructivas, la más notable muestra las típicas molduras en delantal características del Clásico Temprano. En la porción superior del basamento se encuentra un templo de una crujía equipado con una banqueta.

Durante la exploración de este edificio se encontró una escalera interna que conduce a una cámara que contenía los restos de una mujer de alto nivel social, acompanada de una notable ofrenda con diversos objetos, entre los que destaca una pieza de cerámica con la representación de un búho (que da nombre al edificio), una pieza de alabastro con la imagen de un mono, así como una excepcional concha que muestra a un personaje sentado sobre un trono, y adornado con incrustaciones de jade, acerina, pirita y concha nácar.
La Plaza Xibalbá se complementa con dos palacios, denominados norte y sur, cada uno de los cuales cuenta con nueve vanos o accesos, que posiblemente hacían alusión a los nueve niveles del inframundo.

El segundo conjunto que puede ser visitado es el de Kinichná, nombrado así por Thomas Gann a partir de un elemento en estuco con la representación del glifo kin (sol o día), que se conserva en la parte posterior de la Acrópolis. Este conjunto se encuentra dos kilómetros al norte del conjunto principal y se distingue por una acrópolis monumental de tres niveles y diversos templos distribuidos con el arreglo tripartita característico de la arquitectura del Clásico Temprano. A la fecha han sido explorados los templos de los tres niveles, quedando sólo por ser intervenido el basamento del primer nivel. Aunque se detectaron algunos saqueos, en el interior de estos edificios se recuperaron importantes ofrendas y entierros que confirman la importancia simbólica y ritual de este complejo arquitectónico.

La acrópolis de Kinichná se complementa con una serie de edificios bajos alrededor de una plaza, que posiblemente funcionaron como plataformas para templos menores, o bien como edificios de función habitacional.

Se localiza 81 kilómetros al noroeste de la ciudad de Chetumal, capital del estado. Se accede a él siguiendo la carretera federal 186 Chetumal-Escárcega, y en el kilómetro 58 debe tomarse la desviación de 14 kilómetros que conduce al poblado de Morocoy; al llegar a este poblado, continuar dos kilómetros por el camino que va hacia San Pedro Peralta y doblar a la izquierda en el punto marcado por los senalamientos.

El camino de terracería de siete kilómetros que parte de este punto, conduce directamente al sitio.